Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VBP1P61758 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VBP1P61758 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms