Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TMEM258P61165 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TMEM258P61165 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms