Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB15P59190 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RAB15P59190 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB15P59190 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB15P59190 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB15P59190 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB15P59190 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB15P59190 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB15P59190 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB15P59190 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RAB15P59190 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms