Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KLF3P57682 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLF3P57682 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF3P57682 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF3P57682 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF3P57682 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF3P57682 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF3P57682 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF3P57682 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF3P57682 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLF3P57682 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLF3P57682 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLF3P57682 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms