Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSCP56915 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSCP56915 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSCP56915 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GSCP56915 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSCP56915 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSCP56915 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GSCP56915 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GSCP56915 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GSCP56915 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GSCP56915 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GSCP56915 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms