Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAG2P55895 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAG2P55895 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms