Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB4P54760 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms