Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAD23AP54725 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms