Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3M2P53677 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP3M2P53677 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms