Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DAP3P51398 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DAP3P51398 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DAP3P51398 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DAP3P51398 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DAP3P51398 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DAP3P51398 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DAP3P51398 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DAP3P51398 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DAP3P51398 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms