Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK8P49336 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK8P49336 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK8P49336 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK8P49336 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK8P49336 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK8P49336 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK8P49336 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK8P49336 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms