Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMAN1P49257 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms