Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TNNT2P45379 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT2P45379 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms