Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATA4P43694 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATA4P43694 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATA4P43694 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GATA4P43694 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GATA4P43694 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GATA4P43694 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms