Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZEB1P37275 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms