Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHI3L1P36222 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHI3L1P36222 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms