Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCM5P33992 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM5P33992 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM5P33992 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM5P33992 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM5P33992 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM5P33992 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM5P33992 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM5P33992 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM5P33992 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM5P33992 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM5P33992 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM5P33992 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM5P33992 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM5P33992 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCM5P33992 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCM5P33992 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCM5P33992 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCM5P33992 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM5P33992 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM5P33992 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM5P33992 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MCM5P33992 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms