Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXC12P31275 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXC12P31275 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms