Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLIP1P30622 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP1P30622 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms