Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TM4SF1P30408 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF1P30408 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms