Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC27P30260 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC27P30260 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC27P30260 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC27P30260 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms