Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMOD1P29536 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMOD1P29536 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms