Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB2P29033 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB2P29033 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB2P29033 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GJB2P29033 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB2P29033 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms