Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PEX2P28328 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PEX2P28328 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PEX2P28328 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms