Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ITGA3P26006 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ITGA3P26006 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms