Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMA3P25788 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms