Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPREP23469 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPREP23469 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPREP23469 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPREP23469 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPREP23469 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPREP23469 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPREP23469 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPREP23469 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPREP23469 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPREP23469 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPREP23469 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPREP23469 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPREP23469 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPREP23469 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPREP23469 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPREP23469 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms