Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASTP20810 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASTP20810 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASTP20810 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASTP20810 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms