Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGCP20142 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGCP20142 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGCP20142 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PGCP20142 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms