Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VCLP18206 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VCLP18206 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VCLP18206 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VCLP18206 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms