Protein–RNA interactions for Protein: P17927

CR1, Complement receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CR1P17927 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CR1P17927 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CR1P17927 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CR1P17927 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CR1P17927 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CR1P17927 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CR1P17927 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CR1P17927 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CR1P17927 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CR1P17927 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CR1P17927 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CR1P17927 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CR1P17927 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms