Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTPS1P17812 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTPS1P17812 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTPS1P17812 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTPS1P17812 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTPS1P17812 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTPS1P17812 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTPS1P17812 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTPS1P17812 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTPS1P17812 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTPS1P17812 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTPS1P17812 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTPS1P17812 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTPS1P17812 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTPS1P17812 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTPS1P17812 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms