Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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