Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RLBP1P12271 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms