Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NR2F1P10589 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms