Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM225BP0DP42 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM225BP0DP42 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms