Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SAA2P0DJI9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SAA2P0DJI9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms