Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEFMP07197 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEFMP07197 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEFMP07197 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFMP07197 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFMP07197 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFMP07197 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFMP07197 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFMP07197 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFMP07197 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFMP07197 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFMP07197 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEFMP07197 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFMP07197 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFMP07197 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFMP07197 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFMP07197 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFMP07197 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFMP07197 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFMP07197 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEFMP07197 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEFMP07197 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms