Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms