Protein–RNA interactions for Protein: P04430

IGKV1-16, Immunoglobulin kappa variable 1-16, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-16P04430 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-16P04430 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms