Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TOMM40O96008 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOMM40O96008 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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