Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SEC24BO95487 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC24BO95487 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms