Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX6O95475 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX6O95475 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX6O95475 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX6O95475 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX6O95475 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX6O95475 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX6O95475 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX6O95475 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX6O95475 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX6O95475 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX6O95475 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX6O95475 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SIX6O95475 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SIX6O95475 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SIX6O95475 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SIX6O95475 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX6O95475 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX6O95475 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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