Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN5O75503 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN5O75503 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN5O75503 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN5O75503 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN5O75503 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN5O75503 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN5O75503 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN5O75503 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN5O75503 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms