Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIN3BO75182 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIN3BO75182 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms