Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATG13O75143 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATG13O75143 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATG13O75143 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATG13O75143 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATG13O75143 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms