Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCN2BO60939 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms