Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PDE6DO43924 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6DO43924 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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