Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYNGR2O43760 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms