Protein–RNA interactions for Protein: O15438

ABCC3, Canalicular multispecific organic anion transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3O15438 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC3O15438 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC3O15438 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms